Il gameplay è un mix di generi, spaziando dall'avventura al gioco di ruolo e strategia. Gioca come Dan, il protagonista della serie, ma anche come altri 5 combattenti oltre 30 livelli attraverso 6 estese zone di New Vestroia da esplorare e conquistare.

Bakugan Rise of the Resistance proporrà il sistema di battaglie visto nella serie New Vestronia e permetterà così ai giocatori di sperimentare un nuovo stile e un nuovo gameplay rispetto ai videogame precedenti. Ci saranno più di 30 livelli attraverso 6 diverse aree di Nuova Vestronia, da esplorare come combattente e da conquistare e difendere come Bakugan. Con 35 Bakugan a propria disposizione i ragazzi potranno scatenarsi in epiche battaglie sulla propria Nintendo DS.
Ci saranno 32 bakugan unici e 6 diversi boss da sconfiggere.

Combina le modalità di gioco più popolari del momento:

• Modalità strategica "Difendi La Torre" con difficoltà crescente.
• Combattimento in tempo reale.
• Allenamento in stile Bakugan Battle Trainer.